Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc27Q3V036 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms