Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm27235Q3UW50 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Gm27235Q3UW50 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm27235Q3UW50 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm27235Q3UW50 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm27235Q3UW50 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm27235Q3UW50 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm27235Q3UW50 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm27235Q3UW50 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Gm27235Q3UW50 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm27235Q3UW50 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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