Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Skap2Q3UND0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms