Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
BtrcQ3ULA2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms