Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm648Q3UJ22 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm648Q3UJ22 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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