Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx27Q3UHD6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms