Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttll12Q3UDE2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ttll12Q3UDE2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttll12Q3UDE2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttll12Q3UDE2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttll12Q3UDE2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttll12Q3UDE2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttll12Q3UDE2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttll12Q3UDE2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ttll12Q3UDE2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttll12Q3UDE2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttll12Q3UDE2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms