Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U595 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U595 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U595 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms