Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms