Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fndc4Q3TR08 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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