Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms