Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam107bQ3TGF2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fam107bQ3TGF2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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