Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Rpusd3Q14AI6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Rpusd3Q14AI6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Rpusd3Q14AI6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Rpusd3Q14AI6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpusd3Q14AI6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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