Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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