Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Spatc1Q148B6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Spatc1Q148B6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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