Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms