Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn2bQ0KL01 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ubxn2bQ0KL01 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ubxn2bQ0KL01 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ubxn2bQ0KL01 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ubxn2bQ0KL01 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ubxn2bQ0KL01 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ubxn2bQ0KL01 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms