Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
MitfQ08874 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MitfQ08874 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms