Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Siah1bQ06985 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms