Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cab39Q06138 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms