Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms