Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tff2Q03404 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 299.9 ms