Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Thbs2Q03350 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms