Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgfr4Q03142 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fgfr4Q03142 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms