Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnnb1Q02248 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms