Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ascl1Q02067 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms