Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms