Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EgfrQ01279 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EgfrQ01279 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EgfrQ01279 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EgfrQ01279 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EgfrQ01279 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EgfrQ01279 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
EgfrQ01279 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EgfrQ01279 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EgfrQ01279 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms