Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms