Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nbr1P97432 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms