Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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