Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mesp1P97309 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mesp1P97309 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms