Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H3f3aP84244 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms