Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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