Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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