Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tp53bp1P70399 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tp53bp1P70399 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tp53bp1P70399 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tp53bp1P70399 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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