Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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