Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf6P62331 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms