Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps11P62281 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps11P62281 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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