Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ufm1P61961 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ufm1P61961 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ufm1P61961 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ufm1P61961 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ufm1P61961 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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