Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf13P61216 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Taf13P61216 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms