Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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CtdsplP58465 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CtdsplP58465 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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CtdsplP58465 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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CtdsplP58465 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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CtdsplP58465 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CtdsplP58465 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CtdsplP58465 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CtdsplP58465 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CtdsplP58465 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CtdsplP58465 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CtdsplP58465 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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CtdsplP58465 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CtdsplP58465 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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CtdsplP58465 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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CtdsplP58465 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CtdsplP58465 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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CtdsplP58465 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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CtdsplP58465 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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CtdsplP58465 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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CtdsplP58465 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CtdsplP58465 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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CtdsplP58465 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CtdsplP58465 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CtdsplP58465 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CtdsplP58465 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CtdsplP58465 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CtdsplP58465 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CtdsplP58465 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CtdsplP58465 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms