Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

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Length 788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CastP51125 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CastP51125 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CastP51125 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CastP51125 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CastP51125 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CastP51125 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms