Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms