Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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VdrP48281 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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VdrP48281 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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VdrP48281 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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VdrP48281 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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VdrP48281 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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VdrP48281 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VdrP48281 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms