Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pik3caP42337 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms