Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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