Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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