Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxrgP28705 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxrgP28705 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms