Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Hoxd10P28359 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Hoxd10P28359 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Hoxd10P28359 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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